药物治疗(性激素治疗)
主要目的是抑制雌激素合成，使异位种植的子宫内膜萎缩，或切断下丘脑-垂体-卵巢轴的刺激和出血周期。对于较大的巧克力囊肿，不宜采用性激素治疗。
手术治疗
腹腔镜是目前手术治疗内异症的主要手段。
如果你还希望怀孕——
有生育要求的重度患者，宜采取保留生育功能的手术，切净或破坏异位内膜病灶，保留子宫双侧或一侧卵巢，至少保留部分卵巢组织。
如果你不打算怀孕——
对于不打算怀孕的年轻重度患者，宜采用保留卵巢功能手术，将盆腔内病灶及子宫予以切除，保留一侧卵巢或部分卵巢;术后用性激素治疗巩固。
对于不再打算怀孕、年龄较大的重度患者，考虑采取根治性手术，将子宫、双侧附件及盆腔内所有异位子宫内膜病灶予以切除和清除。即使术后体内残留部分病灶，亦将逐渐自行萎缩、退化直至消失;对于子宫周围严重粘连无法切除子宫的患者，可仅切除双侧卵巢或双侧附件，称为去势手术。
