肠胃问题
早产儿因为肠胃道不成熟，不只蠕动慢，消化能力也不好。且容易因胎儿呼吸窘迫症、缺氧缺血，或是因为免疫能力不足而发生坏死性肠炎，严重者可致死。
脑部及神经问题
早产儿可能因为脑部血管脆弱，而出现新生儿颅内出血，影响了运动或认知神经的发育，造成日后学习迟缓，甚至是脑性?痹。有时也会因为神经系统的伤害，而造成听力受损。
肝脏、血液问题
早产儿的肝脏可能因为p-450酵素制造不足，而较易出现黄疸的情况。同时凝血因子因为肝脏制造有限，所以容易有出血（肠胃道或是颅内出血）的状况。
免疫系统问题
早产儿常需依赖全静脉营养点滴的注射或呼吸器的辅助来维持生命，所以需于新生儿加护病房中照顾，因而常发生病菌入侵。一旦病菌侵入早产儿体内，因为他们没有功能成熟的免疫系统来帮忙对抗这些病菌，很容易发生严重的全身性感染。
