有关同性恋起因是生物学或心理学原因的争论在某些方面是很激烈的，但其论点都不具有十分可靠的论据。以弗洛伊德为代表的精神分析学派认为是“异性恋恐怖”，认为是儿时的遭遇在潜意识中种下了异性恐怖的种子，所以成年之后便害怕与异性作性的接触。行为学派认为是环境的影响，往往由于与异性交往受挫造成的人际关系的不愉快经验妨碍了他们正常的心理发展。生物学因素中的主要问题是激素水平是否存在决定性作用?大多数女性同性恋者在青春期后的激素水平是正常的，只有约1/3可见雄激素水平升高，但这一发现对于建立同性恋定向是不能成立的。同样可以推断的是出生前的激素状态也不能决定性行为的定向发展。女性性行为与雄激素的关系至少不像男性那么明确，在这一方面的个体差异也是很大的。也有人企图以遗传学理论来解释同性恋，认为性倾向是与生俱来的，但证据显然太少，还不足以说明问题。最近有人提出同性恋者大脑中视上核核团增大，细胞数目增多，但尚待进一步证实。
同性恋，一种或多或少的想与同性的人发生肉体亲昵关系的愿望，可以认作是自然的和生命经历中的正常变化。只有在把主要兴趣放在与生殖器有关的性行为上时，同性恋才是异常的，而把所有非生殖器的性活动统统说成是违背自然的这种论点实在是太狭隘了。
