从形状上辨别
宁夏枸杞和内蒙古枸杞都呈长圆形，但是宁夏枸杞泡水后会上浮，内蒙古枸杞会下沉，而新疆枸杞呈圆形，容易区分。这几种枸杞都以粒大饱满为上品。因为用白矾水泡过以后会使枸杞果粒变大，所以很多商家采用这种方法。但是明矾泡过的枸杞很好辨别，把这种枸杞对光照射的话，药材表面会有闪亮的晶点;另外“毒枸杞”摸起来黏糊点，天然枸杞则较干燥。
从气味上辨别
对于被硫磺熏蒸过的枸杞，只需要抓一把用双手捂一阵之后，再放到鼻子底下闻，如果可闻到刺激的呛味，那么就可以肯定被硫磺熏蒸过。
从口味上辨别
宁夏枸杞是甘甜的，吃起来特别甜，但是吃完后嗓子里有一丝苦味;而内蒙古、新疆等地的枸杞甜得有些腻，白矾泡过的枸杞咀嚼起来会有白矾的苦味，至于打过硫磺的枸杞，味道呈现酸、涩、苦感。
正规枸杞也有质量优劣之分
如果都是正规的枸杞，那也会因产地与加工方法的不同，质量出现高低之分。一般特级品种的枸杞颜色呈暗紫红色而且均匀，没有黑头;而质量差的枸杞颜色红得很不均匀，而且有很多黑头。
由于地理气候条件不同，各地枸杞的品种和外观也不尽相同。新疆枸杞个头圆，含糖量高，颜色发紫，泡水后水色红，易下沉;内蒙古枸杞粒大，显长圆形，味甜，色泽暗红，裸籽重，泡水微红，易下沉;河北枸杞比较瘦弱，长扁形，味甜而略酸;而正宗宁夏枸杞粒大、肉厚、皮薄，味甘甜、色鲜红，泡水清淡，裸籽轻，泡水易上浮，药效高。
除产地不同外，枸杞的质量还取决于加工方法的不同。目前枸杞的加工方法主要有两种：一种是烘干，一种是晒干。烘干的加工量大，成本相对高，但时间短，可较好地保持枸杞的营养成分;晒干就是利用太阳光，把大多经过处理的枸杞晒干。烘干的颜色很浅，没有自然晒干的颜色那么新鲜，但是晒干的枸杞往往营养价值没有烘干的高。
