内分泌异常：
男性正常生精功能依赖于下丘脑—垂体—性腺轴功能的正常，其中任何一环节障碍，都会影响生精功能，其它如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。
自身免疫：
生殖免疫学研究发现，男性自身免疫可影响生育能力，抗精子抗体可影响精子的产生和运送。
精索静脉曲张：
精索静脉曲张导致的不育症占男性不育的30%～40%。由于睾丸温度升高及毒素淤积等原因使睾丸生精功能受到影响，引起少精症，严重的可造成无精症。
精索静脉曲张初起症状不明显，病情重者可感觉阴囊部坠胀，上面突起如蚯蚓状血管团。精液检查可见，精子数量下降，活动度差，畸形精子数增多。
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