在一般情况下，女性自身并不产生免疫反应，只有约15%～18%的女性不孕患者体内有抗精子抗体存在。通常是由于在女性经期或患有子宫内膜炎等疾病时，子宫内膜损伤或者肛门性交患者，导致精子及其抗原物质易于进入血流而激发女性的抗精子免疫反应。
一些不孕女性的子宫颈黏膜及子宫内膜含有产生免疫球蛋白G和A的淋巴样细胞，子宫颈黏液内含有抗精子的免疫球蛋白G、A和M。故子宫颈及女性生殖道对精子具有局部免疫作用。
女性卵子、生殖道分泌物、激素等溢出生殖道进人自身的周围组织，也会造成的免疫反应，在体内产生相应的抗体物质，影响了卵泡成熟和排卵。此外，女性体内抗性腺激素抗体和抗性腺激素受体的抗体可造成卵巢早衰，卵巢性闭经。子宫内膜异位症于月经周期中可产生分解物，由巨噬细胞系统消除，剌激抗体产生而造成自身免疫。
