对于大多数多囊卵巢综合症的病人来说，月经不正常是引起她们注意的症状，再大意的女人都会联想到，月经不正常会不会影响将来的怀孕能力。
评价月经不规律的主要指标是月经周期，从月经的第一天至下次月经的第一天的间隔时间就是一次月经周期的时间，一个正常排卵月经周期是28－30天。排卵时间在月经周期的第14天左右。月经周期少于24天或大于35天一般都认为是异常的无排卵月经。
当然也不是说所有的30天月经周期就意味着一定有排卵，有一部分特殊的周期没有排卵，只是按时内膜脱落出血，内分泌检查和内膜病理可以帮助确认有没有排卵。
常见的多囊卵巢综合症月经不正常的类型是稀发排卵，月经周期延长超过35天，更常见的是2－3个月或以上的周期，只要每年排卵少于8次（包括8次），且月经周期超过35天就可以称之为稀发排卵，是诊断多囊卵巢综合症的三大症状之一。
稀发排卵的治疗按病人要求而定，有些无需治疗。但月经周期3个月以上或无排卵的病人，尤其是青春期女孩还是需要积极治疗，因为长期在低雌激素状态下，子宫发育不良或萎缩会影响将来的妊娠。
另一种较为常见的类型为功能性子宫出血，即不规则或不可预知的出血，周期不定，经期出血时间长，持续不断，有些月经量大，时间长会引起贫血。这种类型的月经失调需要积极治疗。
