目前对此病发病的机理有多种说法，其中被普遍认可的是子宫内膜种植学说。此外，子宫内膜异位症的发生还与机体的免疫功能、遗传因素、环境因素有关。
月经疾病、经期不注意卫生以及其他的妇科手术造成的影响都容易引发该疾病。诸多因素能促使子宫内膜异位的发生，子宫内膜异位症主要原因：
1、生殖器官异常
为什么会子宫内膜异位？某些先天性缺陷、后天损伤或疾病等造成生殖道梗阻，而致月经血倒流至盆腔，如无孔处女膜、阴道黏连、闭锁、宫颈的黏连闭锁等。
2、妇科手术操作
多次做人工流产手术会使子宫腔内压力改变，子宫收缩，很难避免子宫内膜碎片和血液通过输卵管进入盆腔。近年来剖腹产手术增多，也增加了将子宫内膜种植在子宫肌壁、盆腔、腹壁等部位的机会。未严格掌握放置宫内节育器的规定及术后并发症处理不及时，均可增加经血逆流、子宫内膜种植的可能性。
3、子宫位置不正
正常子宫位置为前倾前屈，以利于经血流出，如果子宫后倾后屈，尤其程度较重者，容易造成经血流出不畅，积聚子宫腔，使子宫腔内的压力增加，给经血逆流进入腹腔创造了条件。
4、宫腔手术时常用宫缩剂
这种情况会使子宫收缩，而机械挤压也是该病发生因素之一。
5、月经疾病
为什么会子宫内膜异位？月经期间，盆腔充血，子宫敏感，收缩的频率及强度增加，假如不留意情志调理，过分激动，紧张易怒，焦虑恐惧；劳累过度，剧烈运动，体位突变；尤其在行经期间不忌房事。
