引起逆行射精的发病原因很多，包括膀胱颈神经调节功能紊乱（如糖尿病、脊柱裂），精阜增生，尿道憩室或狭窄，先天性尿道瓣膜，手术损伤膀胱颈神经支配或手术致膀胱颈关闭不全，此外还有一些药物也能造成逆行射精（如利血平、胍乙啶、苯甲胍等）。
由糖尿病引起的应首先治疗糖尿病，至于脊柱裂所致的逆行射精恐难纠正。精阜有炎症时应行抗炎治疗，精阜增生明显者可经尿道作电切。药物治疗对糖尿病、腹膜后淋巴结切除、交感神经切除等所致的逆行射精也有较好疗效。其他药物包括丙咪嗪、左旋多巴、顺烯丁二酸对治疗逆行射精也有一定疗效。定期尿道扩张术对尿道狭窄者有效，它能轻轻按摩精阜，疏通射精通道等处的轻微梗阻，确保其通畅，从而使一部分逆行射精患者的症状得到缓解。
膀胱尿道镜检查也可起到这种尿道扩张作用。常有胰岛素依赖型糖尿病引起的阴部神经损害，以致膀胱颈部功能失调，关闭机能减弱，射精时不能同步收缩。应用肾上腺素能阻滞剂，如利血平、胍乙啶、溴苄胺等。
